注意事項：
（1）本文是美國本科階段開設微生物學專業的學校列表，共統計有210所綜合性大學、47所文理學院以及2所地方性大學。綜合性大學包含USNEWS排名前200的所有學校外加10所USNEWS世界排名較高或各州的公立旗艦學校，文理學院統計的是USNEWS排名前50（3所軍事院校除外）的學校，2所地方性大學分別為：紐約市立學院和克雷頓大學。未區分綜合性大學和文理學院，則表示該專業未有文理學院開設。
（2）本文所示的本科綜排為2015USNEWS美國綜合性大學排名，世界排名為2015USNEWS世界大學排名美國國內排名；“-”代表該校未進入排名榜單
（3）“專業名稱”和“專業英文名”為該校實際開設的專業名稱——同一專業各個學校的叫法可能不同，也有部分學校會將多個專業組合在一起開設，形成組合學科，或交叉學科，因此同一個專業各個學校實際對應的專業項目名稱是不盡相同的。
學校列表
| 綜合排名 | 世界排名 | 學校名稱 | 專業名稱 | 專業英文名 |
| 20 | 3 | 加州大學伯克利分校 | 微生物學 | Microbial Biology |
| 23 | 8 | 加州大學洛杉磯分校 | 微生物學，免疫學與分子遺傳學 | Microbiology, Immunology, and Molecular Genetics |
| 29 | 14 | 密歇根大學安娜堡分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 37 | 18 | 加州大學圣地亞哥分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 38 | 37 | 加州大學戴維斯分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 40 | 28 | 加州大學圣塔芭芭拉分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 42 | 66 | 加州大學爾灣分校 | 微生物學與免疫學 | Microbiology and Immunology* |
| 47 | 27 | 威斯康辛大學麥迪遜分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 48 | 14 | 華盛頓大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 48 | 53 | 佛羅里達大學 | 微生物與細胞科學 | Microbiology and Cell Science |
| 48 | 52 | 賓州州立大學公園分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 53 | 30 | 德克薩斯大學奧斯汀分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | 51 | 馬里蘭大學學院公園分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | 42 | 匹茲堡大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | - | 克萊蒙森大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | 205 | 佐治亞大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | - | 楊百翰大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 62 | 69 | 普渡大學西拉法葉分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 68 | 86 | 德州農工大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 70 | 55 | 羅格斯大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 71 | 29 | 明尼蘇達大學雙城分校 | 微生物學 | microbiology |
| 71 | 121 | 愛荷華大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 76 | 114 | 印第安納大學伯明頓分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 76 | - | 邁阿密大學（俄亥俄） | 微生物學 | Microbiology |
| 76 | 115 | 馬薩諸塞大學阿默斯特分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 85 | 75 | 密歇根州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 85 | 484 | 佛蒙特大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 88 | 381 | 阿拉巴馬大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 95 | 213 | 北卡羅來納州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 99 | 253 | 內布拉斯加大學林肯分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 99 | - | 新罕布什爾大學 | 生物醫學：微生物學 | Biomedical Science: Medical Microbiology |
| 103 | - | 奧本大學 | 微生物學 | Microbial, Cellular and Molecular Biology Microbiology Option (MCMB) |
| 106 | 208 | 堪薩斯大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 106 | 155 | 愛荷華州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 106 | 171 | 田納西大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 106 | 284 | 俄克拉荷馬大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 113 | 127 | 加州大學河濱分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 121 | 64 | 亞利桑那大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 121 | 241 | 科羅拉多州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 129 | 143 | 亞利桑那州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 129 | - | 路易斯安那州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 129 | - | 俄亥俄大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 138 | 250 | 俄勒岡州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 138 | 325 | 華盛頓州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 145 | 438 | 俄克拉荷馬州立大學 | 微生物學 | Microbiology, Cell and Molecular Biology |
| 149 | 492 | 圣地亞哥州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 156 | - | 密西西比州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 156 | 438 | 德克薩斯理工大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 161 | 299 | 南佛羅里達大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 161 | - | 懷俄明大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 161 | - | 羅德島大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 166 | - | 愛達荷大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 168 | - | 西弗吉尼亞大學 | 免疫學與醫學微生物學 | Immunology and Medical Microbiology |
| 168 | 321 | 夏威夷大學馬諾阿分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 173 | - | 緬因大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 173 | - | 波爾州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 173 | - | 博林格林州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 181 | - | 北達科他州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 181 | - | 南達科他州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 189 | - | 南伊利諾伊大學卡本代爾分校 | 微生物學 | Microbiology |
| 194 | - | 內華達大學雷諾分校 | 分子微生物學與免疫學 | Molecular Microbiology & Immunology |
| 194 | - | 蒙大拿大學 | 微生物學 | Microbiology |
| 194 | - | 中密歇根大學 | 微生物學 | Biology: Microscopy |
| RNP | - | 新墨西哥州立大學 | 微生物學 | Microbiology |
| RNP | - | 蒙大拿州立大學 | 微生物學 | Microbiology |